上海市红十字会从1992年始开展造血干细胞捐献工作，是全国首批开展非血缘关系骨髓捐献供者工作的五个城市之一。1995年，通过上海一位白血病患者的求助呼吁，在社会上引起了强烈的反响，当时有1000多人报名加入骨髓库。1996年，在上海市红十字会、上海市血液中心和华山医院通力合作下，成功施行了全国首例非血缘关系外周血造血干细胞移植手术，上海建设银行员工孙伟成为中国大陆捐髓第一人。 

      1997年，中华上海骨髓库成立，加快了志愿者的征募速度。1999年，造血干细胞捐献志愿者突破一万人，为6位白血病患者找到相配的捐献者。2001年，上海市红十字会和共青团上海市委联合开展了“为了生命的希望工程——上海青年造血干细胞捐献志愿者行动”，当年征募志愿者8000人，库容迅速增加到2万人。

      2003年，经中国造血干细胞捐献者资料库管理中心批准，中华上海骨髓库更名为中国造血干细胞捐献者资料库上海市分库。上海市分库获得2004年首届和2005年第二“捐献骨髓 拯救生命”优秀新闻作品“最佳组织奖”等奖项，并荣获2003年—2005年和2006年—2007年省级分库建设目标管理考核“优秀省级分库”、“2005年突出贡献奖”等称号。

      截至2009年9月30日，上海市分库入库人数达到94542人，成功移植150例，继续保持全国领先地位。